企業級高速分析平臺 解碼基因大數據

亞大基因讓資料科學家加速精準醫療

撰文記者 徐淨
日期2018-03-16
兩位來自趨勢科技的軟體工程師–張明台(左二)與蘇中才(右一),聯手創辦亞大基因,要挑戰基因體中的「駭客」。

當今基因體時代趨勢,隨著定序技術飛躍式的進步,成本已自2009年10萬美元,大幅下降至現在只要數百美元便可達成。然而,這些大量的定序資料若未經處理,終究只是一堆沒有資訊意義的符碼。整體產業鏈價值將繼續往下游探伸,真正能夠提升基因價值,需借助這群數據科學家。


撰文/徐淨 攝影/林以璿

亞大基因科技兩位共同創辦人─張明台和蘇中才,來自知名防毒軟體科技公司─趨勢科技,過去,他們負責對付的是網路安全、電腦病毒。2015年4月,兩名軟體工程師發現新的題目,決定離開舒適圈,挑戰基因體中的「駭客」。

在偶然的機緣下,兩位和臺大醫院基因醫學部醫師陳沛隆和臺灣大學生物產業機電工程學系教授陳倩瑜聊到當前臨床醫學面臨到的瓶頸,「現今基因資料量的產生快速而大量,卻沒有足夠的資訊能量應對。」

因對大數據處理的經驗,兩位燃起了創業基因,決定利用擅長的數據挖掘演算法(data mining algorithm)彌補這個缺口。他們也認為這是一個嶄新、領先並具有意義的題目,「不想只做一些『for fun』的東西,我們想要對人類健康有實際價值的貢獻。」執行長張明台說道。

談起新創之初,兩位也表示,趨勢科技開放創新的公司文化是重要的一波助力。「當初Eva (趨勢科技執行長陳怡樺)也很支持我們內部創業,也是重要天使人之一,只不過,我們的題目和資訊安全比較沒有直接相關,所以才另起新創。」張明台表示。

探索汪洋未知的98.5%

雖然,自2001年人體基因圖譜初步里程碑達成,至今已過十餘年光景,然而,過去醫學對基因體與疾病之間的關係僅專注在外顯子(Exon)區域,最多只占基因體1.5%左右。若想連那龐大的98.5%基因體資訊一起處理,現有的分析工具處理效率不佳,而全球的臨床醫學正往全外顯子定序(whole-exome sequencing, WES)、全基因體定序(whol...