總體基因體學幫助找到新型CRISPR抑制蛋白

撰文記者 薛瀹熢
日期2019-02-11
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總體基因體學幫助找到新型CRISPR抑制蛋白 (圖片來源: 網路)

來自丹麥技術大學的科學家利用了總體基因體學(Metagenomics)技術,跳脫了以往科學家在尋找CRISPR抑制蛋白(Anti-CRISPR protein)上的困難,成功找到了四種能夠用於抑制CRISPR系統的新蛋白質。新的方法不僅改善了尋找CRISPR抑制蛋白的方法,也有可能在未來進一步幫助改善CRISPR-Cas9基因編輯系統的脫靶效應。他們的研究結果近日(5)發表於《Cell Host & Microbe》。

對CRISPR-Cas9系統來說,脫靶效應是基因編輯過程中所面臨的一個很大的問題。因此假如能引入抑制CRISPR作用的物質幫助研究,將可能改善CRISPR效率與準確性。然而目前已知能夠抑制CRISPR的蛋白質非常稀少,僅有數種被發現。以往科學家都是透過直接檢視嗜菌體DNA來尋找CRISPR抑制蛋白,由於這個發現過程僅能聚焦於一個非常小的範圍中,也間接導致了CRISPR抑制蛋白的尋找困難。

「之前CRISPR抑制蛋白都是從嗜菌體裡找到,然而我們對這些嗜菌體的基因組通常缺乏了解,不清楚大部分基因的功能。」領導本次研究的Morten Sommer說。他同時也...