定序技術新革命!亞洲準譯攜美Element Biosciences「AVITI™」來臺上市  

撰文記者 吳培安
日期2024-10-22
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亞洲準譯繼今年8月成為美國Element Biosciences (Element)在臺代理商後,即將在10月31日共同舉辦AVITI™定序平台在臺產品展演會。(圖/亞洲準譯提供)

亞洲準譯繼今年8月成為美國Element Biosciences (Element)在臺代理商後,即將在10月31日共同舉辦AVITI™定序平台在臺產品展演會。亞洲準譯技術長莊景凱表示,相較於其他NGS平台,AVITI™能以更低的運行成本和靈活的應用模式改變了市場格局,非常適合希望加速研究進程、降低成本的中小型實驗室和研究中心​。
 
莊景凱說明,AVITI™定序平台的技術基礎為親和力鹼基化學 (Avidity Base Chemistry, ABC),這項創新技術讓AVITI™擁有卓越的精確度與穩定性,降低定序過程中錯誤讀取的發生。莊景凱強調,Q40~Q50的高品質讀取代表99.99%~99.999%的正確率,這在病原體檢測和基因變異分析中特別重要。
 
此外,AVITI™的雙槽設計允許用戶在不影響分析結果的情況下,同步進行多種應用,包括基因體和轉錄體分析,靈活應對不同實驗需求。
 
「這樣的技術創新不僅提高了分析的靈活性,也進一步推動了在生物醫學領域的多樣化應用,包括感染病源檢測、腫瘤研究及藥物篩選等。」莊景凱說。
 
莊景凱進一步指出,AVITI™除了定序儀,同時也是一種多體學的分析平台,能夠一次性分析多達200萬個細胞,還能在單一樣本中執行RNA、蛋白質及細胞形態的多體學分析。
 
「近年來單細胞研究領域非常活躍,特別像是藥物篩檢免疫細胞和癌症研究等。透過AVITI24™直接在晶片上完成細胞培養、送定序,單細胞研究和定序儀從此不用分成兩台完成,能夠成為單細胞研究的絕佳夥伴。」莊景凱說。
 
此外,Element即將在明年推出的Trinity™,能以AVITI™ 系列設備為基礎,來完成在定序晶片上進行探針富集的實驗步驟,藉由自動化操作程序,省去了探針雜合、磁珠吸附、洗滌、擴增等步驟,將手動操作時間縮短至45分鐘,藉此將傳統探針捕獲實驗的操作大幅簡化。
 

開啟精準醫療新篇章!亞洲準譯建全臺第一間AVITI™示範實驗室 

 
莊景凱表示,亞洲準譯作為臺灣感染病原基因定序檢測的領導者,與Element Biosciences合作建置全臺第一間AVITI™示範實驗室,旨在突破目前臨床檢測的局限。
 
「感染症尤其是在面對未知病原時,傳統的診斷方法常常無法及時且精準地確定感染源,這導致抗生素耐藥性(AMR)問題日益嚴重。AVITI™能夠快速、準確地辨識病原體,使臨床醫師能夠對症用藥,避免廣效性抗生素濫用,這將對全球公共衛生危機中的抗生素耐藥性問題產生積極影響。」莊景凱說。
 
不過,莊景凱也強調,NGS雖然可以精準辨識病原體,但檢驗報告仍必須爭取時間,不能太晚完成,「特別是加護病房(ICU),如果報告超過3天才完成,那麼就算找出正確感染源也已經為時已晚!這也是我們這次希望代理AVITI™ 來臺的原因之一。」
 

亞洲準譯已經與Element Biosciences合作建置全臺第一間AVITI™示範實驗室。左:亞洲準譯營運長李定寰;右:亞洲準譯執行長劉君豪。(圖/亞洲準譯提供)
 
莊景凱說明,在經過亞洲準譯的測試後,驗證AVITI™ 的定序量能一次可讀取20億條序列、最多可同時進行50個樣品,還可以依照當天收到的需求量做彈性制定安排,快速產出準確的報告。
 
「對醫學中心來說,AVITI™中通量定序平台的特性在運用上更具彈性,樣品量不用很多就能上機。相較於類似規格的定序平台具有較低的成本和較高的準確度,於醫學中心、地區型醫院、醫學研究中心等在分子診斷的應用上更具優勢。」莊景凱說。
 
目前,亞洲準譯除了獲得國內首家mNGS的LDTs列冊核准,也與臺灣共計18家醫學中心展開mNGS臨床試驗,其中血液感染部分已經完成,證明在敗血症的檢出上,相較於傳統血液培養的病原檢出率可提升62%,其他試驗如骨關節感染及中樞神經系統感染也已完成試驗,目前正在進行論文的撰寫,而肺炎的臨床試驗也正在進行中。
 

AVITI24™:單一平台實現多體學分析 準確度最高可達Q50 

 
亞洲準譯表示,此次展演會是AVITI™平台在臺灣的首次亮相,會中將有一系列深度介紹,包括Element Biosciences執行長Molly He親臨現場,說明AVITI™平台如何改變定序技術在生物醫學領域的應用,並帶來更靈活、更高效的解決方案。
 
此外,日本東京大學鈴木穣(Suzuki Yutaka)教授,將透過海外連線分享AVITI™平台的研究經驗。鈴木穣團隊專精於基因體定序、累積豐富的定序平台使用經驗,其團隊已在AVITI™平台上成功驗證運行、並取得超過Q40(錯誤率0.01%)的高品質數據。
 
莊景凱也將在活動中展示如何將AVITI™技術應用在臨床微生物檢測及多體學分析上,協助研究者與臨床醫師突破現有檢測的瓶頸。

報名連結:https://go.elementbiosciences.com/2024RoadshowTaipei

 

10月31日舉辦的展演會,是AVITI™平台在臺灣的首次亮相。(圖/亞洲準譯提供)
 
(報導 / 吳培安)