全臺第一家!亞洲準譯mNGS實驗室落成 挑戰臨床未知感染症

即時撰文記者 吳培安
日期2020-04-16
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亞洲準譯於今(16)日宣布成立全臺第一家病原微生物體次世代定序(mNGS)。左起:圖爾思實驗長莊景凱、亞洲準譯行銷經理陳俊融、亞洲準譯執行長劉君豪、亞洲準譯營運長李定寰、圖爾思生物資訊技術長郭育倫。(攝影:林嘉慶)

今(16)日,由圖爾思生物科技衍生之「亞洲準譯股份有限公司」(Asia Pathogenomics, APG),宣布成立全臺第一家病原微生物體次世代定序(mNGS)實驗室,預計在今年5月送出醫學實驗室國家認證申請、9月取得認證。

亞洲準譯執行長劉君豪指出,現今基因定序成本大幅下降、使得高通量的基因定序成為可能,再加上微生物體(microbiome)研究的崛起,使得mNGS成為相應而生的尖端領域。目前全世界只有美國、中國在發展mNGS,臺灣若在此時乘勢加入,將能成為全球mNGS領域的前段班。

劉君豪表示,亞洲準譯是圖爾思生技集團邁向臨床應用、所成立的第一家衍生公司,鎖定的是mNGS的應用領域中,最具臨床應用潛力的「不明感染症臨床檢驗」。

「目前在多種急重症感染疾病,例如重症肺炎、敗血症、腦炎/腦膜炎的臨床檢驗上,都有15-60%的比例無法檢出病原。有了mNGS,我們可以更全面的找出未知的病原,甚至連目前在全球疫情延燒的新冠肺炎(COVID-19),當初也是透過mNGS發現、定序出來的!」劉君豪說。

劉君豪執行長表示,亞洲準譯是圖爾思生技集團邁向臨床應用、所成立的第一家衍生公司。(攝影:林嘉慶)

劉君豪執行長表示,亞洲準譯是圖爾思生技集團邁向臨床應用、所成立的第一家衍生公司。(攝影:林嘉慶)

營運長李定寰說明,mNGS透過定序的方式,可鎖定檢體中所有的遺傳資訊,一次性完成細菌、真菌、病毒、寄生蟲等共12,593種病原檢測,相較於傳統檢驗更全面。此外,還可以在2-3天內取得結果報告,未來也期待能藉此有效降低病人住院的時間,從而降低健保的支出。

實驗長莊景凱表示,亞洲準譯此次完工的mNGS病原檢測醫學實驗室,屬於P2結合負壓等級實驗室,可處理低感染性的臨床檢體。實驗室從收取檢體到檢驗報告出爐,分成五個清潔度不同的空間執行,全程在負壓梯度的實驗空間內進行,以將環境和檢體間的交叉汙染降到最低。

此外,亞洲準譯使用的資料庫經歷5年的臨床實踐累積,彙整了數萬種病原序列、數萬篇輔助臨床判定的文獻庫,以及數萬例真實樣本訓練建構檢測背景庫,共同組成保證準確性、特異性的臨床級別資料庫,相較於NCBI上的公共資料庫序列,能更有效的解決臨床上難以分析的感染症病原體。

目前亞洲準譯已與北、中、南超過10家醫學中心合作,待未來通過認證後,就可以開始將mNGS病原檢測服務帶入臨床應用。