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(攝影/吳培安)
藥物合成及分析核心設施
藥物合成及分析核心設施，是以高階技術協助解決藥物研發相關合成及分析問題，該核心設施由三大單元構成，包含：化學及藥物合成核心、質譜分析核心與核磁共振核心。
化學及藥物合成核心，主要是利用高階化學合成技術，提供不對稱合成、新型藥物代謝中間體合成、小分子與生物製劑偶連、標準樣品合成、可量化合成途徑規劃、新穎合成途徑規劃及合成技術諮詢等服務，以最有效率方式完成新藥開發及量化相關客制化專案服務。
核磁共振及質譜分析核心，則擁有多年在小分子定性定量及結構生物學的實力及豐富的核心服務經驗，提供高精密與高解析度的結構鑑定及定量分析服務，以協助國內學研、產業開發大小分子藥物所需的各式分析。
(攝影/吳培安)
人類治療性抗體研發平台
單株抗體具高專一性、低排斥性，可廣泛應用於癌症、自體免疫及感染性疾病的治療優勢，目前人類治療性抗體研發平台已成功建立700億株的噬菌體顯現全人源天然抗體庫(含scFv與Fab)，並掌握小鼠融合瘤、單一B細胞篩選技術，建立700億株抗體的噬菌體顯現抗體庫(含scFv與Fab)，提供抗體篩選的最佳策略，支援抗體研發。
該平台已成功協助學研開發多種抗體，包括：癌細胞抑制抗體、中和與檢測用抗體、抗藥抗體、辨識突變點抗體、辨認胜肽與醣分子之抗體，以及應用於細胞治療與奈米藥物傳輸之scFv與Fab抗體。提供國內外抗體工程客製化與優化服務，推動新穎抗體研發快速進入轉譯與臨床。
(攝影/吳培安)
生醫轉譯核心共儀設施
生醫轉譯核心共儀設施(CFTM)則致力於串聯學術研究與生醫產業，推動基礎研究成果加速應用於臨床，此核心共儀設施提供高階儀器、教育訓練、技術研討、操作協助、客製化服務與合作開發計劃。
在核心共儀設施中，整合高階多維度影像、細胞分析與分選、外泌體分析、單細胞與空間體學基因分析、自動化活細胞檢測、智慧型藥物篩選、數位組織病理平台，助力細胞、分子、藥物及臨床研究。
目前已成功協助企業開發CAR-T及NK細胞功能檢測標準，驗證小分子藥物結合細胞治療的療效，加速學研團隊建立藥物篩選，並協助醫研機構完成幹細胞修復模式。
(攝影/吳培安)
RNA技術平台與基因操控核心設施
RNA技術平台與基因操控核心設施(原RNAi核心)，是全臺灣唯一結合「基因操控技術」以及「重組病毒載體」的技術資源中心；該核心設施整合RNAi、miRNA、CRISPR/Cas、cDNA各式基因操控試劑資源，結合偽慢病毒、反轉錄病毒、腺相關病毒、類病毒顆粒等病毒載體系統，為全國學、研、醫、產業界提供試劑資源與技術服務。
目前RNA技術平台與基因操控核心設施有來自全國生醫領域使用者，其也積極參與並支援國內生醫轉譯研究工作，累積的成功案例，包括：協助國產新冠疫苗開發、支援CAR-NK細胞治療研發工作。
(攝影/吳培安)
臺灣小鼠診所
位於國家生技研究園區的臺灣小鼠診所(TMC)，為臨床前小動物藥物測試的專業平台，致力提供高品質、一站式、客製化且具時效性的實驗動物服務。
TMC攜手中研院動物影像設施、陽明交大腦科學研究中心小動物影像核心設施、成大醫學院實驗動物中心與高雄長庚紀念醫院實驗動物型態鑑定暨診斷核心實驗室等核心設施，共組「台灣動物設施聯盟(TAC)」，建立北中南跨區域合作網絡，便利全台使用者。TAC擁有完整設備，提供小鼠表現型分析、藥物靶點活體確效、新適應症開發、安全性與毒性評估，協助產學研加速臨床前藥物開發流程。
(攝影/吳培安)
動物影像設施
動物影像設施專注於提供實驗動物專用的先進核磁共振(MRI)影像技術，整合實驗設計、技術開發與數據分析，並延伸應用於各類生物醫學研究。藉由高解析度影像平台，協助產學研界推進藥物開發與轉譯醫學研究，促進臺灣生醫研發能量與國際接軌。
該設施可提供多元服務，包括：客製化MRI影像與動物模型建置、整合式評估方案、專業影像判讀與後處理分析、非活體掃描服務，以及完整的動物實驗諮詢與設計支援，協助研究人員精準掌握實驗進程與成效。
(攝影/吳培安)
核酸先導設施
核酸先導設施已建立全台首個具放大能力的mRNA與mRNA-LNP製程與品質分析平台，涵蓋從製程開發、品質控管到法規支援的一站式服務。該平台可依據不同性質、長度與序列的mRNA藥物，進行製程參數優化，提升回收率並降低副產物生成，並提供超過20項mRNA與mRNA-LNP的檢測項目，確保產品品質穩定。
此外，核酸先導設施已完成符合GMP原則的先導工廠建置，輔以品質保證(QA)管理系統，可支援從早期研發到臨床一期所需的mRNA與mRNA-LNP生產、品質分析與穩定性測試等，同時亦提供相關法規與文件撰寫支援，以加速創新核酸藥物的臨床轉譯與商品化進程。
(攝影/吳培安)
感染性疾病核心設施
感染性疾病核心設施(Infectious Disease Core, ID Core)的目標則是為協助國內產官學研各單位，開發因應重要傳染病的疫苗、藥物、預防/治療性抗體、篩檢試劑等，並結合防疫一體(ONE HEALTH)概念，建立本院完善的傳染病防治策略，積極參與、協助國家防疫。
ID Core設有國家級動物暨生物安全第二等級(ABSL-2/BSL-2)實驗室、以及高防護(ABSL-3/BSL-3)實驗室，結合完善之病原檢測、免疫橋接分析等高階技術平台以及臨床前動物(如:小鼠、倉鼠、雪貂等)試驗，可提供疫苗/藥物篩選及產品效能驗證的一站式服務，協助產官學研各單位執行新技術與產品的安全性與效能驗證，將研究成果轉化為具臨床應用潛力的產品。
