瑞典發佈全球首個癌症病理圖譜 解密人體所有蛋白編碼基因

撰文記者 王柏豪
日期2017-08-20
20170820 環球生技 編譯

實現個人化醫療,真的越來越近了!

上週《科學》期刊發表,全球首個癌症病理圖譜問世。來自瑞典皇家理工學院等機構研究人員發佈了一篇「人類癌症病理圖譜(Human Pathology Atlas)」,其建立的圖譜包含超過90萬條可預測患者生存期的生存曲線,和500萬幅病理學影像。

這份研究對近8000名患者的基因資料進行分析,得出了17種常見癌症中,全部蛋白編碼基因表達的情況,將如何影響不同癌症患者的預後及生存。可從蛋白水準和腫瘤的代謝變化預測病患腫瘤的發展,以對病患進行更針對性的治療,在癌症患者個人化治療上,科學家們又邁出了重要一步。

此外,研究人員還將這次的資料和以前所用的基因組規模代謝網路模型(GSMM,包含代謝物、基因和代謝中的生化反應,可以分析代謝,預測生長情況)結合,為這次研究中的每個樣本建立了個體化的GSMM。

基於這個模型,研究人員可以研究腫瘤的代謝,分析不同的代謝條件下腫瘤的生長速度,發現增加生長速度的物質,找到產生它所需的酶,通過控制酶的編碼基因來控制腫瘤的生長。

最後,研究人員確定了2553種必需基因,可以抑制或殺死腫瘤,其中55個是患者體內常見的。但在這些必需基因中,絕大多數同時也會影響正常組織的代謝,所以當進行標靶測試時,正常的組織也會受到了不小的傷害,若在人體內,就會產生副作用,因此,這些必需基因對應的蛋白質並不適合作為藥物開發的標靶。

然而,研究也發現,有參與癌細胞核苷酸代謝的32個基因被標向時,對健康組織沒有太大毒副作用,所以,有可能成為潛在的治療標靶。此一模型的建立和分析,將是癌症患者進行個人化治療的一個途徑。

這次研究的通訊作者是瑞典皇家理工學院的Mathias Uhlén教授,他也是歐洲生物技術聯合會的主席,是人類蛋白質圖譜專案(Human Protein Atlas,HPA)的領導者之一。Uhlén並將這次「癌症病理圖譜」的研究資料成果公開放在http://www.proteinatlas.org/pathology網站,供其他研究人員和患者取得。

Uhlén教授表示,「這項研究與之前的類似研究不同,它不是將注意力集中在與癌症有關的突...