張鋒團隊指出,TIGR系統由TIGR相關蛋白與嚮導RNA組成,TIGR相關蛋白具有與特定RNA結合的成分,該成分可與gRNA互相作用,精準抵達基因體中特定位點作用。
張鋒研究團隊先前曾將細菌CRISPR系統改造成基因編輯工具,徹底改變了現代生物學。因此他們進一步尋找新的可編程系統,團隊針對CRISPR-Cas9蛋白與gRNA結合的特徵進行研究。
張鋒表示,透過搜尋數億種具有已知或預測結構的生物蛋白質,團隊從Cas9中發現一種名為IS110的蛋白質,先前已有其他人證實該蛋白能夠結合RNA。
隨後,他們利用人工智慧(AI)對發現的蛋白進行分類,最終發現了超過20,000種不同的TIGR相關蛋白,主要存在於感染細菌的病毒中。
這些蛋白由具有規則間隔的重複序列的基因編碼,稱為TIGR陣列,會編碼出gRNA,並與蛋白質的RNA結合區域相互作用,且在某些情況下,RNA結合區域與蛋白質上欲切割的DNA片段相鄰,代表TIGR相關蛋白可以精準靶向DNA目標。
研究團隊接著對數十種TIGR相關蛋白進行實驗,證實其中某些蛋白可以被編程來切割人類細胞的DNA。
TIGR基因編輯系統 比Cas9小1/4、可任意靶向編輯
張鋒指出,TIGR相關蛋白不像CRISPR需要仰賴原型間隔子相鄰基序(PAM)的短DNA序列才能辨識目標DNA,TIGR相關蛋白可以更靈活地靶向任意位點。研究團隊也證實,TIGR系統具有雙重引導系統,可與DNA雙股螺旋的兩條鏈相互作用,來定位目標DNA序列。
此外,TIGR相關蛋白平均只有Cas9的四分之一大小,更容易遞送,有望克服基因編輯療法目前的遞送障礙。
目前,張鋒團隊正在研究TIGR系統在病毒中的自然作用,以及如何應用到治療中,他們已確定了其中一種TIGR相關蛋白的分子結構,並發現TIGR系統與人類細胞中某些RNA處理(RNA-processing)蛋白之間的關聯,有望加速其研發效率。
參考資料:https://news.mit.edu/2025/ancient-rna-guided-system-could-simplify-delivery-gene-editing-therapies-0227
論文:https://www.science.org/doi/10.1126/science.adv9789
(編譯/李林璦)