歐美政府、跨國藥廠為何來臺叩門?

解密世界AI神秘艦隊――AILabs防疫航行路線

撰文記者 巫芝岳
日期2020-07-23
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攝影/巫芝岳
台灣人工智慧實驗室(AILabs)利用人工智慧輔助臺灣政府投入科技防疫,無論從病毒實驗室資料庫大數據分析、胸腔X光輔助診斷系統、病毒演化傳播、到社交距離app等等,都極為領先世界,並面向國際發表,也吸引跨國藥廠、歐美政府防疫政策諮詢紛沓而至,世界智慧防疫秘密基地原來在臺灣,並已經對世界作出了貢獻。
全球新冠肺炎(COVID-19)一些疫情已經趨緩的國家,確診感染病例再次顯著上升,第一波疫情還沒結束,「第二波」疫情高峰又已危機四伏。
相較其他國家,臺灣在第一線防疫、醫護人員及全民的團結努力下,國內COVID-19疫情趨於平穩,「防疫新生活運動」已經讓民眾在抗疫之餘,也能放鬆享受生活,大部分的人這時心裡或許稍稍鬆下了一口氣。
這半年,臺灣寫下的抗疫奇蹟,不僅登上國際期刊、被40餘家國際媒體報導,也釣出許多民間高手潛藏的實力。
當眾多目光都聚焦在創造奇蹟的口罩國家隊時,其實還有一艘神祕低調、少曝光的「沉默艦隊」,在疫情還沒大爆發前就開始與疾病管制署密切聯絡、合作,利用大數據、人工智慧「軟」科技,在疫情中不斷出謀獻策。
這艘沉默艦隊,即是PTT之父――杜奕瑾創辦的台灣人工智慧實驗室(AILabs)。
打開AILabs新冠肺炎專頁,出現的是AILabs卷軸式的抗疫研發時間軸。跟著游標導引前進,AILabs在疫情下提供的解決方案一目了然,也象徵臺灣在新冠疫情影響下初、中、後階段抗疫的各個里程碑。

兩大現有AI平台

病毒基因溯源尋找來源

去年12月31日,疫情尚未爆發之初,PTT上的鄉民就熱烈討論武漢市衛生健康委員會的緊急通知貼文,該貼文聲稱武漢市第2醫院出現疑似SARS冠狀病毒感染,讓疾管署豎起神經。
大學期間一手創辦PTT,被鄉民稱為是「PTT創世神」的杜奕瑾也嗅到事情不單純,便開始想AI能為這場疫情做些什麼?
AILabs先前就和疾管署合作過「人工智慧輔助瘧疾血片自動判讀」計畫,這次也不例外,這艘沉默艦隊就像俄亥俄級戰略核潛艇一樣伺機而動。
杜奕瑾接受訪問時表示,1月初就和疾管署討論,一但拿到病毒株後可以做哪些分析和應用,AILabs也先從大家好奇的問題:「病毒從哪裡來?」、「有特效藥嗎?」開始尋求解答。
1月中,臺灣第一個新冠病毒定序結果出來,AILabs有了可靠的數據來源,即刻開始分析,AILabs首先使用2018年與台灣微軟合作建置「TAIGenomics基因分析平台」掏金解題。
更多的病毒定序數據出來後,AILabs將中東呼吸症候群冠狀病毒(MERS)、嚴重急性呼吸道症候群(SARS)、蝙蝠身上的冠狀病毒與新冠病毒(SARS-CoV-2)的基因序列,利用多重序列比對程式MAFFT分析後,在動態親緣關係樹(Phylogentic Tree)上呈現。
他們發現新冠病毒親緣最接近的是SARS,兩者相似度達82.30%,其次是蝙蝠身上的冠狀病毒,最後是MERS。


20萬篇新冠相關文獻輔助
病毒變異位點鉅細靡遺

接著,當大家對於病毒起源眾說紛紜時,AILabs已經將新冠病毒序列與資料庫比對,分析新冠病毒的宿主來源,並發現一株一月底才被中國上傳的中菊頭蝠(Rhinolophus affinis)身上冠狀病毒株RaTG13序列,其與新冠病毒序列相似度高達 96.12%。
杜奕瑾說,「雖然96.12% 的相似度已經很高,但兩者間還有1,100多個基因位點的差異,專家認為這樣的差異,在演化上至少需要20年以上的時間,因此還需要更進一步研究才能論定中菊頭蝠是否為此次疫情最初的中間宿主。」
隨著疫情不斷持續,大量的研究陸續產出,一向秉持「開放、分享」杜奕瑾為了讓研究者能夠快速查找與新冠病毒相關文獻,AILabs在已有的「Variant2literature平台」上新增近20萬篇與新冠相關的文獻。
使用者只需要輸入如SARS、MERS、nCoV、Pneumonia、Wuhan等關鍵字,即可找到所有相關的文獻,同時會將文獻中有提及基因、變異、疾病與臨床案例等字句用紅字標示出來,讓研究者能夠更快速找尋病毒與變異點位關聯的文獻。
「Variant2literature平台」2018年12月上線後,至今被使用37,515次、索引了8,220,588篇論文和30,238,345篇摘要,在342,817篇論文中,總共鑑定出8,477,056個人類變異。
目前這兩個平台,都開放給大家使用,杜奕瑾說「與其用傳統的分析工具,不如結合臺灣最先進的人工智慧分析,讓成果能更快分享給世界。」

早於瑞德西韋
公布全球首份「老藥新用」清單

果不其然,國外藥廠、各國政府線上紛沓而至。
接著疫情從亞洲擴散,全球確診數如滾雪球般增加,國際間開始致力研發專治COVID-19的藥物。
一月底在泰國、美國醫療團隊分別傳出使用治療流感與愛滋病...