日前(7月29日),於2024亞洲生技大展來台展出的加拿大基因體研究新創BioAro宣布,與台灣新創公司矽晶定序高速科技(GeneASIC)簽署合作備忘錄(MoU)。BioAro將提供其獨有的 PanOmiQ軟體 ,與GeneASIC以FPGA、ASIC晶片為核心開發的超快速NGS 數據分析解決方案結合,預計將打破全基因體定序(WGS)定序時程,將整體時間縮短至45分鐘。
據了解,BioAro除了在加拿大外,在中東也有所布局,此次與台灣新創GeneASIC合作外,BioAro也正在和台灣其他企業進行合作洽談。
BioAro是一家以基因體學、人工智慧和區塊鏈技術結合的生物科技公司,致力提供全基因體定序、微生物體學測試和軟體解決方案。
BioAro在今年4月推出 PanOmiQ軟體,該軟體提供一站式解決方案,可適用全基因體、全外顯子定序(WES)和散彈槍微生物體定序(shotgun microbiome sequencing)的初級(primary)、二級(secondary)、三級(tertiary)資料分析,以實現7小時內完成不同體學資料集的分析。
BioAro也透露在與GeneASIC合作下,全基因體定序時程縮短有望至45分鐘。
GeneASIC則是由台灣大學與陽明交通大學實驗室於2020年技術移轉,並在上市公司愛普科技等公司共同投資下成立的新創公司,GeneASIC專長在於結合生物資訊及電子晶片設計。
GeneASIC目前開發出以現場可程式化邏輯閘陣列(FPGA)、特殊應用積體電路(ASIC)晶片為核心技術的硬體設備——NGSAAP。FPGA是一種可彈性使用,可不斷修正、開發,加速電腦運算過程的工具,可加快資料數據分析。
GeneASIC透過FPGA與ASIC為基礎打造的「基因特用晶片」,搭配生物資訊演算法軟體,可為NGS提供高效分析運算的解決方案。舉例來說,定序深度為30倍(30X)的全基因體定序,在二級資料分析上,30分鐘內就能完成。
此外,該設備僅有一個電腦主機大小、功耗低,無須建置特定機房,GeneASIC期望實現定序技術的去中心化,普及精準醫療,目前已推廣到臺灣數家醫院。
BioAro創辦人兼執行長 Anmol S. Kapoor表示,這次合作不僅代表了精準醫學領域的突破,也逐步實現BioAro在打破基因體學研究界限,包括更快、更準確以及更方便的基因體檢測目標。
(報導/彭梓涵)