6月26日,美國加州由台裔科學家徐安祺(Patrick Hsu)建立的Arc Institute團隊及東京大學西増弘志(Nishimasu Hiroshi)帶領的研究團隊合作發現了一種新分子,橋接RNA(bridge RNA)。bridge RNA來自細菌的跳躍基因,它能增加、刪除、重組和反轉DNA序列,其基因編輯的功能可能克服一些CRISPR的限制。研究團隊一共發表兩篇論文,皆發布於《Nature》。
CRISPR問世十年,為科學家帶來新的基因編輯方法,但它在使用上有限制。CRISPR必須在破壞雙股DNA的情況下進行編輯,這可能造成潛在的毒性。此外,它無法嵌入較大或完整的基因,其CRISPR-Cas9系統中的嚮導RNA (Guide RNA, gRNA)只能辨別一條標靶的DNA鏈。
研究團隊發現,不同於CRISPER的gRNA只能指定要切割的標靶序列,bridge RNA能識別兩條DNA,一條為標靶DNA,一條為嵌入DNA,而這兩條DNA都是可以編輯的,研究人員能針對標靶序列和嵌入序列進行設計,混合搭配出任何想要的組合。
研究團隊起初是發現某個細菌的跳躍基因IS110,在跳出基因序列後會自我環化,並摺疊成兩個環。一個環結合到需要嵌入的DNA靶向位置,另一個連結IS110自身,在兩者間形成橋梁。
Arc Institute團隊對bridge RNA的基因編輯能力展開研究。他們利用bridge RNA系統高精度地將大段DNA嵌入大腸桿菌中,切除並反轉大腸桿菌DNA。研究人員於論文中表明,至少在細菌中,bridge RNA的每端都能編輯,以連接並操控兩邊的DNA。
徐安祺表示,這個機制在未來可以用於細胞療法及基因治療中,例如插入嵌合抗原受體(CAR)或缺失的基因,又或者切除、反轉有問題的DNA來解決重複序列及基因易位引起的疾病等。
研究人員接下來將研究如何利用bridge RNA系統在人體中發揮作用,並研究提高精確性及效率的方法。此外,他們也打算進一步探究其他IS110能用於基因編輯的功能。
參考資料:1.https://www.fiercebiotech.com/research/no-crispr-no-problem-jumping-gene-system-could-be-bridge-complex-gene-editing
2.https://www.nature.com/articles/s41586-024-07570-2
3.https://www.nature.com/articles/s41586-024-07552-4
(編譯/實習記者 林庭語)
《Nature》功能超越CRISPR?台裔科學家徐安祺攜手東大教授發現bridge RNA
撰文實習記者 林庭語
日期2024-07-02
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柏克萊加州大學(UC Berkeley)生物工程系助理教授徐安祺(Patrick Hsu)。(圖片來源:UC Berkeley官方網站)