日再生團隊AI+縮時攝影 2週誘導漸凍症iPSC、成功率達8成

撰文記者 彭梓涵
日期2024-12-30
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(圖片來源:《Stem Cell Reports》)
近日,由日本慶應義塾大學(Keio University)教授暨再生醫學會(JSRM)理事長岡野榮之(Hideyuki Okano)領導的研究團隊,開發一種以縮時攝影顯微鏡(time-lapse microscopy)結合機器學習的技術,在單細胞基礎上,快速從誘導性多潛能幹細胞(iPSC)中篩選型態和活力具有肌萎縮側索硬化症(ALS)病理的功能性脊髓下運動神經元(LMN),助力ALS的病理機制研究並促進藥物篩選。研究已發表在《Stem Cell Reports》。
 
ALS是一種神經退化性疾病,儘管已有許多科學家投入其研究,但因為ALS缺乏明顯的遺傳異常訊息,且病程表現出高度異質性,其病理機制至今仍未被全面揭示。
 
對此,iPSC能誘導成為疾病模型,並評估該疾病治療藥物效果與了解病理機制,使其成為ALS研究重要工具。但目前以iPSC誘導ALS疾病模型,還存有誘導效率低、及誘導純度不足的挑戰,這些技術限制,使得在需要大量樣本以克服個體差異的ALS研究中,仍存在諸多困難亟待解決。 
 
為提升iPSC分化成具有ALS表型的神經細胞,岡野榮之領導的團隊,先利用一組小分子化合物包括:TGF-β抑制劑、GSK-3β抑制劑、BMP抑制劑處理iPSC連續7天,使其誘導成類胚胎體(embryoid body),再經過仙台病毒(Sendai viruses )將轉錄因子Lhx3、Ngn2和Isl1轉染進iPSC。
 
接著團隊利用縮時攝影的顯微鏡和機器學習方式,在單細胞層級中,分析誘導出的脊髓下運動神經元的型態和活力,並排除不具ALS表型的脊髓下運動神經元,以有效建立神經退化性疾病病理生理學評估系統。
 
現在研究團隊僅需2週時間,就能從iPSC快速誘導具有ALS特異性病理,如TDP-43和FUS蛋白異常聚集的脊髓下運動神經元,誘導效率可達80%,明顯改善傳統的誘導效率。
 
岡野榮之表示,我們建立的新方法,有效簡化了過往勞動密集且重複的流程,有望為未來ALS大規模分析和藥物篩選打開大門。
 
資料來源:
https://www.genengnews.com/topics/artificial-intelligence/ai-expedites-motor-neuron-analysis-and-screening-in-als-research/
https://www.cell.com/stem-cell-reports/fulltext/S2213-6711(24)00321-7