今(15)日，國衛院舉辦「精準健康暨院長就職研討會」，邀請來自美國、新加坡、日本的海外學者，及國內包括陽明交通大學副校長楊慕華、中研院生物醫學科學研究所所長郭沛恩及多名國內遺傳學專家，分享如何推動基因檢測更普及化使用，以及包括對頭頸癌、聽損罕見疾病，臨床上實際應用基因檢測的案例及成果。
 

Stephen F. Kingsmore：罕病基因體計畫BeginNGS 推新生兒基因檢測普及化

加州雷迪兒童基因組學研究所(Rady Children’s Institute for Genomic Medicine)所長Stephen F. Kingsmore，針對目前由多家醫院、生技公司、設備商等，與政府共同合作的新生兒罕病基因體計畫「BeginNGS」介紹。
 
BeginNGS為一項開放、全球性、透過公私合作進行的計畫，其內容包含：所有嬰兒應進行新生兒WGS篩檢(針對符合Wilson及Jungner篩檢準則的700多種疾病)；對於確診者，應儘速使其得以治療；加速相關孤兒藥的研發；建立罕病終生照護的平台等。
 
Kingsmore表示，他們的目標，是要發展能讓新生兒接受基因檢測的系統，且該系統應具成本效益、能被保險給付，預計規模為5年內1百萬名新生兒。
 
未來，更希望進一步透過AI工具分析，加速這種普篩式檢測的效果；要達到此步，必須透過基因體工廠(genome factory)、AI分析後，再進入回饋的迴圈，讓AI進行自我學習。
 

Jason Chin：泛基因體分析工具 解開人類基因體重要區域變異

GeneDX 定序科技及演算法副總裁Jason Chin，介紹了泛基因體(Pangenome)研究工具的實際應用，例如和國衛院蔡世峯合作，解開臺灣人基因體中重要區域的變異性，如MHC Class 2、HLA Class 2等；或是，透過快速比對數份不同的基因體，找出與疾病相關的遺傳變異區域，研究的罕見疾病例如聽力損失、威廉氏症候群(Williams syndrome)等。
 
然而，Jason Chin也指出，雖然基因體科技本身已經到位，但這項技術價格依然高昂、需要大量人力作業，此外也需要更多基因體資料儲存、執行泛基因體分析和高通量功能性分析的工具，才有機會在未來進入臨床應用。
 

吳振吉：NGS助力嬰幼兒聽損手術預後、基因療法開發

台大新竹分院耳鼻喉科主治醫師吳振吉，介紹了台大在嬰幼兒聽力缺損基因研究上的成果。他表示，嬰幼兒神經性聽損(SNHI)其實並不罕見，目前治療方式可透過植入電子耳(cochlear implant)。他表示，藉由基因檢測進行的診斷與治療，目前已證實能更預測植入電子耳的預後，也可望幫助基因治療開發。
 
吳振吉表示，在國內透過次世代基因定序(NGS)，分析先天性聽損相關基因的研究中，他們已找出重度(severe-to-profound SNHI)和輕至中度SNHI，在基因突變上略有不同。運用更詳細的基因資訊和AI分析，他們得以預測患者何時應進行手術，也能預測植入電子耳得預後是否會較好。
 

楊慕華：頭頸癌無主要驅動基因突變 但遺傳學仍是治療契機

陽明交通大學副校長楊慕華，則分享其利用遺傳學分析，嘗試找出針對頭頸癌(HNC)的有效治療策略，因為頭頸癌幾乎沒有主要的驅動基因突變(driver gene mutation)，使得標靶療法難以施展。
 
儘管如此，楊慕華的研究仍指出，頭頸癌的病程中，與癌症低氧(hypoxia)相關的訊號、腫瘤遷移和腫瘤微環境之中，仍有值得研究、有機會成為治療契機的分子標靶；此外也有EGFR抗體和免疫檢查點抑制劑(ICI)，以及多重激酶抑制劑(multikinase inhibitor)和ICI的結合，在臨床治療上可能仍有效果。
 

Joanne Ngeow：精準醫學實際執行「眉角」多 跨地區合作、導入AI分析可成解方

 
新加坡南洋理工大學醫學院副教授Joanne Ngeow，分享了精準醫療在亞洲實際執行上應考量的細節。她表示在說服執政者應將基因檢測納入常規時，通常得考量如何說服政府、病人實際需求為何、保險能否給付等問題。
 
Ngeow認為，藉由臨床癌症基因體資訊、HELIOS/SG100L/PRECISE等從「群眾」而來的基因體資訊等，都是能利用的資源；在台灣和新加坡雙方的比較性研究、導入高通量的分析、機器學習的介入等，也是能增進的；在人力上，增加臨床科學家的訓練也相當重要。
 

山本雅之：NRF2為抗氧化壓力關鍵基因 首次送疾病模型鼠上太空

日本東北大學山本雅之(Masayuki Yamamoto)教授於其演講中表示，KEAP1-NRF2系統在生物體氧化壓力調控中非常重要，並在老鼠模型中累積大量的研究。其中，NRF2和壓力相關疾病(stress-based disease)、抗氧化、抗發炎和代謝重編程(metabolic reprogramming)相關，甚至可能被癌細胞利用、加速惡性生長，因此可說是未來人類癌症治療和精準醫療的重要研究對象。
 
山本雅之最知名的研究，是與日本宇宙航空研究開發機構(JAXA)合作，將剔除了NRF2基因的小鼠送上太空、成為第一組進行太空旅行的疾病模型老鼠，也發現太空旅行造成對NRF2剔除鼠造成的反應，和地球上的老化效應相似。
 

郭沛恩：TPMI解中風重要遺傳因子 大數據需入「指引」才能實際應用

中研院生物醫學科學研究所所長郭沛恩，除了介紹台灣精準醫療(TPMI)計畫外，也分享該計畫目前已實際找出的中風重要基因風險因子之一。郭沛恩分享，在TPMI所收集資料中，經仔細分析發現「體顯性腦動脈血管病變合併皮質下腦梗塞及腦白質病」(CADASIL)這項常見的遺傳性腦血管病變中，帶有某項特定基因突變者更容易發病，因此可望作為中風風險預測的因子。
 
他表示，若要將這些數據轉至健康照護領域，首先需建立在真實世界中各基因風險的評分，同時發展次世代的基因檢測平台，並盡可能收集越多人的數據越好，最終並能提出醫學指引(guideline)，才有機會讓基礎的基因資訊收集，轉為實際應用。
 

蔡世峯：基因體分析揪出BA.2.3.7變異株 有效監控新冠病毒流行趨勢

國衛院蔡世峯特聘研究員，介紹基因體定序在流行病監控上的應用。他表示，Illumina的NovaSeq 6000 在2017年9月進駐國衛院，迄今不只應用在研究人類基因體，也在與疾管局(CDC)合作下，多次投入新冠肺炎群聚感染事件的大規模PCR檢測，調查群聚感染。
 
隨著臺灣步入後疫情時代，基因體分析依然被使用在病毒變異株流行監控中。蔡世峯指出，臺灣的主流病毒株並非像美國以BA.1為主，自從去(2022)年春節起，BA.2逐漸取代BA.1成為主流，且以BA.2.3.7變異株為主，長期流行至今。蔡世峯表示，比起監控病毒的單點突變，基因體分析能更全面地掌握突變株的流行動態，有關BA.2.3.7的研究成果也準備發表在國際期刊中。
 

胡務亮：台大罕病AADC基因療法研發有成 去年取歐盟許可

台大小兒部暨基因學部主治醫師胡務亮，介紹了台大醫院在小兒基因檢測與基因治療的成果。他表示，台大在2019-2022年5月，針對144,004名新生兒進行脂肪酸氧化異常檢測，經由NGS作為第二次檢測，並共找出411名結果異常嬰兒。
 
台大團隊也自行開發罕見疾病芳香族L-胺基酸脫羧基酶(AADC)缺乏症的基因療法，此大腦注射基因療法，在2015年技轉給美國PTC Therapeutics，去年7月獲歐洲藥物管理局(EMA)上市許可，成為AADC首個療法。該療法昨日也剛獲今年國家生技醫療品質獎暨SNQ標章授獎。
 

Biobank、健康老化、跨多體學研究有成 臺灣精準醫療未來可期

在最後的論壇中，國家級人體生物資料庫(NBCT)整合中央辦公室執行長黃淑芬，介紹Biobank在過去兩年來，已經建立12套基礎操作流程(SOP)以及通用資料模組(CDM)；她也表示，在衛生福利部、國衛院、12家醫學中心和4家藥廠的協力下，2021年10月上路至今的「癌症精準醫療及生物資料庫整合平台合作示範計畫」，已成為臺灣最具代表性的公私合作(PPP)案例之一。
  國衛院群體健康科學研究所副所長/研究員許志成，分享了健康老化的精準醫學應用。在國衛院過去的4年健康老化計畫中，已找多項出老化相關生物標記(biomarker)，可用於預測風險(包括認知衰退、肌少症、心血管問題等)，以及評估合適的介入方式幫助高齡者健康。該計畫也是結合學研單位、社區據點、臨床醫院的跨單位計畫。
   
陽明交通大學生命科學系暨基因體科學研究所特聘教授蔡亭芬，分享透過國衛院、宏碁(Acer)、長庚醫院合作的跨多體學(trans-omics)研究成果。其團隊透過蒐集618人的基因體、代謝體及臨床資料，加上AI分析，不僅建立了高風險糖尿病患者惡化為糖尿病腎臟病(DKD)的惡化預測模組，還發現了DKD的器官間溝通(organ cross talk)分子機制。
   
甫卸任的前國衛院院長梁賡義也在閉幕致詞中，回顧了精準醫療在臺灣發展的軌跡。他表示，國衛院在2016年啟動精準醫療旗艦計畫，在2019年進展到NBCT，2021年起開始由上往下，建立精準健康的大數據生態系，並期待未來透過一站式資料庫網站、可信的研究環境和國際合作，發揮健康數據的潛力。
 
(報導 / 巫芝岳、吳培安)