NGS如何從科技殿堂飛入尋常百姓家:15年技術發展脈絡

2021-07-11 / 專欄:基因慧
站在2021年當下,NGS技術已投入使用十餘年,從科技殿堂拾階而下,應用到臨床和社區抗疫一線,回顧底層技術發展脈絡,溫故知新。短讀長、長讀長各有哪些優勢?基礎原理是什麼?主要廠家有哪些?大阪大學微生物病研究所感染症國際研究中心特聘副教授中村昇太(NakamuraShota)在《生物工學會誌》期刊上發文闡述了相關問題,本文編譯原稿如下。撰文/中村昇太編輯/基因慧July審核/Barney【注】本文是...

臨床收案平台、醫療數據分析、基因癌篩新銳 澳廠商來臺尋商機

2021-04-23 / 記者 巫芝岳
今(23)日,澳洲辦事處於臺北舉辦「澳洲創新醫療科技發表會」,邀請來自澳洲的7家醫療科技廠商連線簡介,包括:臨床試驗平台、基因定序癌檢、醫療資料分析、呼吸道疾病遠距照護、AI腦部影像分析、VR解剖教學工具等。這些公司皆成立於10年內,並期望有機會在台尋找到拓展亞洲商務的合作夥伴。澳洲辦事處副代表莫博仁(BrentMoore)首先致詞表示,今天發表的7家公司,領域橫跨臨床試驗、基因檢測診斷、醫療影像...

《NEJM》「全基因體定序」助血癌治療 較常規方法更精準、快速

2021-03-15 / 記者 巫芝岳
近(11)日,由華盛頓大學醫學院(WashU Med)科學家所發表,刊登於頂尖醫學期刊《NEJM》的一項研究指出,比起傳統基因檢測的分析方式,全基因體定序(wholegenomesequencing)能更有效幫助血癌患者的疾病風險評估,進而使其接受更合適的治療。研究人員共評估了263位病人的血液樣本,將這些樣本全基因體定序的結果,和傳統基因檢測所使用的核型分析(karyotyping)進行比較。結...

基因x智慧化x早覺醫療!專家:精準防疫、AI大數據不可少

2021-01-28 / 記者 彭梓涵
報導/彭梓涵 今(28)日,由台灣醫界聯盟基金會舉辦之數位醫療防疫專家會議,系列論壇第二場,以數位科技助攻精準防疫為題,邀請北醫李友專教授、工研院莊曜宇副所長、宏碁智醫許銀雄總經理、圖策智能林清詠執行長,分享疫情下如何運用AI與大數據,讓防疫精準到位。 徹底利用AI才能做到早覺醫療對於AI防疫與精準健康的應用,台北醫學大學醫學資訊研究所特聘教授李友專分享,在後疫情時代,AI可隨分級醫療給予不同的應...

陽明大學發現5關鍵基因 解謎臺灣漢人演化優勢

2021-01-18 / 記者 巫芝岳
報導/巫芝岳今(18)日,陽明大學宣布其生命科學系暨基因體科學研究所的一項研究中,發現了五個關鍵基因,讓臺灣漢人在演化及適應生存環境的過程中,不被天擇所淹沒。該研究也於日前發表於期刊《MolecularBiologyandEvolution》。生命科學系暨基因體科學研究所助理教授可文亞的團隊,透過研究14,401位臺灣漢人的全基因體基因型,及其中772位全基因體序列,找到了CTNNA2、LRP1B...

有史來最大非人類靈長物種變異基因資料庫

2020-12-30 / 記者 王柏豪
編譯/王柏豪由貝勒醫學院(BaylorCollegeofMedicine)、密蘇里大學(theUniversityofMissouri)和華盛頓大學(UniversityofWashington)研究人員所領導,在一項針對恒河猴進行的基因體定序研究中,鑑定出超過8500萬個遺傳變異,這是有史來最大非人類靈長類物種的遺傳變異基因資料庫,該研究發表在《Science 》雜誌上。 由於恒河猴在生物醫學研...

國研院「AI晶片設計驗證平台」攜手臺大、交大研發高速基因定序晶片 較傳統快60倍

2020-06-16 / 記者 吳培安
今(16)日,國家實驗研究院(簡稱國研院)半導體中心宣布,配合科技部半導體射月計畫及我國人工智慧(AI)系統晶片技術發展,成功開發出「人工智慧系統晶片設計與驗證平台」,讓學界可專注於「人工智慧加速電路」的開發,順利將創意發想轉換成完整的AI晶片。國研院表示,AI晶片設計複雜度極高,須具備許多尖端且艱深的技術,如:大數據分析、深度學習演算法、硬體IC設計實現、晶片驗證與量測等,需耗費大量人力、時間與...

莊曜宇:新冠研究應重視宿主基因定序 慎選AI演算法

2020-04-30 / 記者 李林璦
今(30)日,科技部補助臺大全幅健康照護子中心邀請到國內外多位專家舉辦了《TAIWANisHelping:全方位AIx防疫線上論壇》,其中,邀請工研院生醫所副所長莊曜宇以疫情與基因大數據之應用為題,分享他以往在基因大數據的經驗,並呼籲,除了進行新冠病毒本身的基因定序外,應更加重視「宿主的基因定序」,才能清楚了解為何傳播有個體差異性,亦可用於老藥新用的研究或是能更進一步新冠肺炎感染、疾病上的生物資訊...

微生物+基因體成趨勢:NGS檢測病原體、第三代基因定序、牙周病快篩

2020-01-03 / 記者 巫芝岳
今(3)日,在南港中央研究院舉行的亞洲微生物論壇中,針對微生物領域的發展趨勢,邀請了包括圖爾思生技技術長郭育倫、國防醫學院劉正哲副教授、中正大學黃耀廷教授和Pacific8Ventures合夥人傅斯誠醫師等專家,從微生物相關檢測技術應用,到投資趨勢等面向進行分享。目前醫院在病人感染性疾病相關的檢驗上,多使用細菌培養和聚合酶連鎖反應(PCR)等方式,然而隨著基因定序技術的發展,次世代基因定序(NGS...

北京希望組與Oxford Nanopore攜手 三年完成10萬人全基因體定序

2019-04-26 / 記者 李林璦
昨(25),根據基因慧報導,中國基因定序公司北京希望組(GrandOmics)宣布與OxfordNanopore建立戰略合作聯盟,共同構建大規模Nanopore基因定序平臺,預計三年內完成10萬人Nanopore長讀長人類基因組定序計畫——dbSV-100K。 為瞭解基因組結構變異對人類疾病影響,北京希望組(GrandOmics)將展開一項大規模基因定序計畫dbSV-100...

定序新星Quantapore完成1555萬美元C輪募資

2018-07-25 / 記者 徐淨
近日,美國焦點定序公司Quantapore,宣布完成1,555萬美元的第三輪募資。成立於2009年的Quantapore,致力於開發超低成本同時高通量的DNA定序平台,目前正積極將技術成熟商業化。最新一輪募資由北極光創投、清源資本、仙瞳資本領投,百度風投、雲石基金參與其中。董事會陣容亦是相當引人注目,包括北極光創投創辦人FengDeng,以及過去在新技術產品研發及商業化方面、操作高成長公司經營方面...

Bionano Genomics將IPO 拓展第三代定序儀海外市場

2018-07-02 / 記者 彭梓涵
BionanoGenomics日前,將以股票代碼BNGO申請NASDAQ上市,計劃募集至3450萬美元,此次發行的收益以及銷售收入和現有現金將滿足至少18個月的運營現金需求。新推出的全新序列標記技術(DirectLabelStain,DLS),其優勢在於不會對基因組DNA結構造成任何破壞,展現了高靈敏度與辨識度,預計將第三代定序儀拓展海外市場。BionanoGenomics致力於開發基因組圖譜定序...